第31集
琴清醒来，四目交投，少龙情不自禁地相拥。其后少龙自责既要离开又去招惹琴清，滕翼却以为他为未能回到未来而烦恼。琴清从《金石拾遗》中发现硫酸即“胆钒”，兴奋地要为少龙制造硫酸，邹衍劝她动之以情，可能令少龙留下，琴清苦笑应尊重少龙的抉择。琴清根据卖胆钒粉的档主所示，决定亲自上山采掘胆钒，更藉此好好想清楚跟少龙的关系，邹衍无奈慨叹。少龙知道后感惆怅，对李斯与嬴政讨论的减税之法也无心理会。嬴政欲提升李斯当太史，但怕不韦从中作梗，少龙提议拉拢嫪毐，令朱姬跟嬴政同一阵线。嬴政成功说服嫪毐劝朱姬上朝听政，又赐他免死金牌。嬴政与朱姬联手下果然顺利擢升李斯为太史，不韦感气结，急谋对策。娘蓉知道不韦要对付少龙，担心会影响与荆俊的交往，又见荆俊偏帮少龙，怒赶他离开。嬴政与朱姬一唱一和下成功通过减赋税建议，又否决不韦修建大渠的建议，心中乐透。不韦质问朱姬为何联同嬴政对付自己，朱姬冲口说出嬴政非其亲生骨肉，不韦顿觉晴天霹雳，发狂地捏著朱姬的颈，幸嫪毐及时出现。不韦愈想愈气，誓言要嬴政永不翻身。不韦偷会成娇，答应助他夺回王位，成娇心动。嫪毐目睹二人约会，心中盘算。朱姬惊悉不韦对嬴政不利，要告诉他，嫪毐阻止说要趁此机会扳倒不韦。
第32集
善柔惊闻主公要她杀少龙及嬴政，呆立当场。廷芳发现善柔心事重重，再听到她跟哑大叔诉说要杀少龙，大吃一惊。先王陵墓建成，十日后举行封陵仪式，少龙听到不韦抱病不会出席，隐觉不妥。嫪毐约少龙见面，告知成娇秘密返咸阳见不韦，以及不韦得悉嬴政非其亲子，少龙推测不韦欲捧成娇做傀儡大王。廷芳跟踪善柔，见她在树林内设置陷阱，又看见来人身形极像少龙，即扬声示警，其后才知坏了善柔的大事。墓室内，嬴政正向天祷告，成娇带著人马来到杀嬴政，嫪毐与侍卫适时出现擒下成娇。嬴政走出墓室时，三名杀手自石棺跃出刺向少龙，嫪毐以保护嬴政为藉口离开。少龙以一敌三，险象环生，最后被剑直刺入腹部，昏倒地上。善柔冲入墓室，惊见少龙倒卧血泊中，与廷芳合力杀死杀手。少龙昏迷不醒，二女束手无策，廷芳为自己卤莽连累少龙受伤而自责。滕翼等正为少龙忧心忡忡，突见家仆抬著奄奄一息的少龙回来。风尘仆仆的琴清回来看见少龙垂危，拥著他痛哭，剖白心中感觉，少龙突然有反应。嬴政指嫪毐护驾有功，封为长信侯，又逼问成娇造反的幕后主使人，成娇举棋不定，不韦暗示其妻儿在自己手中，成娇心绪紊乱。
第33集
成娇为了妻儿性命，独力承担谋反罪，不韦暗松一口气，嬴政怒将他处死。成娇求不韦放过妻儿，不韦却暗中派人斩草除根。少龙迷糊中分别看见赵倩、廷芳及善柔出现身旁，却又遥不可及。善柔与廷芳偷偷探望少龙后，依依不舍离去。组织派来杀手追杀善柔，幸善柔使计逃过大难。琴清悉心照顾少龙，发誓甘愿牺牲一切让他快乐，少龙突然苏醒，琴清喜极而泣。少龙将秦青归还的颈链送给琴清，说在生死关头的一刻只想起她，琴清感动。滕翼为不韦买凶杀害少龙一事，劝娘蓉不应再跟荆俊来往，荆俊反应激烈。嬴政要诛成娇九族，少龙负伤劝谏，嬴政以斩草除根及叛我者死为由拒绝，少龙心中一寒。嬴政要李斯将少龙的功绩记载入史书，少龙担心自己会在古代人间蒸发，遂与琴清尽情享受相处的每一刻。滕翼神神秘秘拉少龙上山，叫他取出通讯器来“叉电”，原来滕翼一直在测试闪电减压法，成功将闪电力量降低。少龙既感动又犹豫，琴清劝他勿错过返回未来的机会，少龙走入时光隧道，内心交战。不韦编纂《吕氏春秋》，扬言改一字值千金，藉此散播君无道应另选贤能的思想，李斯担心不已。少龙与嬴政发现自己在铜镜内的影像均不消失了，惊惶失措。
第34集
嬴政直指镜中影像消失是凶兆，此时李斯来报，指不韦一党酝酿另选贤能，少龙心绪紊乱。少龙忆起乌博士之言，恍然若嬴政的王位不保，改变了历史，二人自然会消失，急谋对付《吕氏春秋》之策。天上一颗殒石堕落，群臣对“天外飞石”惊惶失措，不韦更指飞石暗寓一国之君失民心，应退位让贤，群臣哗然。少龙则认为飞石另有玄机，指飞石的裂痕上写有“正文之君，受命于天”八字，直指嬴政是真命天子，气煞不韦。赵国派李牧带兵来犯，嬴政欲派少龙做大将军出征，藉此从不韦手中夺回兵权，但不韦、嫪毐亦分别争取出征机会，嬴政无奈让王翦、嫪毐及少龙比试，胜者得帅印。琴清怕少龙出征后重蹈其丈夫覆辙，战死沙场，少龙安慰说会让嫪毐夺得帅印，又说要带她去意大利威尼斯游山玩水，琴清才破涕为笑。比试日，嫪毐一觉醒来发现全身乏力，知道朱姬暗中下药阻止自己出征，勃然大怒。嬴政以保其王位为由，硬要少龙夺取帅印。少龙心知王翦马上功夫厉害，使计夺得帅印，不韦气结。少龙向嬴政举荐王翦做副将，王翦感激。琴清得悉少龙胜出，伤心失望，更忆起新婚之日，丈夫被召入伍及一去不返的情景，泪流满面，心有决定。
第35集
少龙见琴清与邹衍欲离秦，激动地拉琴清到当日山盟海誓之地，与她立下夫妻之约，琴清动容。善柔与廷芳乔装夫妻，沿途小心翼翼，但廷芳过分紧张引起杀手的注意。二女在渡头遇到一队歌舞团，讹称要赶去齐国探望病重的儿子，求班主凤姐的船载二人一程，凤姐答允。团中台柱凤菲一声不响嫁了人，凤姐为没有台柱为齐王贺寿表演而苦恼。杀手混上船伺机杀善柔，幸善柔机警杀之。凤姐无意中发现廷芳貌似凤菲，决定由廷芳假扮凤菲表演。少龙在秦魏边境驻兵，为即将跟李牧交锋而不安。不韦以东郡民变要求嬴政传令王翦先改道往安邑平乱，再赶往蕞城会合少龙，嬴政见嫪毐也支持，无奈答允。李牧相约少龙城楼外会面，少龙归还飞虹剑，二人举杯痛饮，从此恩断义绝。少龙正担心王翦的援军未能按时到达，一群墨者求见相助守城，大喜。岂料两军对垒之际，这群墨者竟倒戈相向，大开城门，少龙恍然中计。少龙与滕翼带著秦兵且战且退，少龙吩咐滕翼带兵先走，自己殿后。李牧吩咐活捉少龙，峡谷的松散沙石滚下，少龙生死未卜。嬴政看见镜中模糊影像，大惊，再接报蕞城失守，跌坐地上。琴清握著少龙送的颈链，祈求少龙能逢凶化吉。
