第一集
少年韦小宝刁钻聪敏，为人口甜舌滑，乃市井之徒。自小随母居住扬州丽春院，韦春花出身青楼女子，与儿子韦小宝相依为命。
韦小宝从小听书听戏，更羡慕戏文中的英雄好汉，为了做英雄，他凭一时之勇杀了黑龙鞭史松，搭救了落难的江湖好汉茅十八。茅十八心里虽感激韦小宝援手，便嘴上却骂他用这种下三滥的手段，是江湖人最看不起的，韦小宝因杀史松不能在扬州呆下去，韦小宝向茅十八死缠不休，茅十八无奈，只好带他离开扬州，前往京城。
在京城酒店内韦小宝惹是生非，茅十八和几个布库打了起来，茅十八摆脱困境，正要带韦小宝离去时，却被一老太监击倒在地，布库把茅十八擒住交给老太监海大富，韦小宝和茅十八被带入宫中审训。
皇宫中，老太监海公公查问茅十八来京目的后，一掌将茅十八打飞出墙外落在杂役的草车上，韦小宝趁海老公公犯病之时，施展诡计，在海老公的药中加重分量，将他眼睛毒瞎，又将小太监名叫小桂子的杀死。
第二集
韦小宝从此便冒充小桂子在宫中做假太监来服侍海老公公。海老公公用摇骰子来试探韦小宝。海老公叮嘱韦小宝去赌博时要把银子借给打扫上书房的温家哥俩。
一日，韦小宝赌博归来，不小心走进了比形厅偷食吃，正遇到一个自称小玄子的小太监来练武，韦小宝便主动上前与他交量，这少年正是小康熙帝玄烨，二人不打不相识。
韦小宝和小康熙从此成了好朋友，小康熙从韦小宝的身上拥有了属于自己年龄的生活，二人互吐心声，给小康熙带来了一段崭新的快乐童年。海大富早已识破韦小宝，也乘机利用他和小玄子的比武来寻找害死荣亲王、董鄂妃、孝康皇后及贞妃的死因，不负老皇爷的重托。
顾命大臣鳌拜对太后的蛮横无礼，让年幼的康熙所忧虑。
第三集
海大富断定小玄子背后的师傅就是宫中高人，夜探慈宁宫探虚实，却看到皇太后在教小康熙练武。
小康熙一直在隐瞒自己身份的情况下和韦小宝玩起了泥巴仗，韦小宝陶醉在快乐之中，早已忘记了海老公公的重托，海老公公要韦小宝逼迫温家哥俩还银子，如还不上，就让他们哥俩带你到上书房见一见皇上，趁机偷一本叫《四十二章经》的书。
温家哥俩果然中了海老公公的计，就挑皇上不在的时候让小宝进上书房看了看。
大殿之上，鳌拜不满康熙维护苏克萨哈，为了显示自己的势力，以及给康熙一个下马威，私自假传圣旨把苏就地处决。企图谋夺帝位。小康熙深知也无可奈何。
小韦小宝等待小玄子来摔跤，不知不觉地也来到了大殿上，让众臣误认是刺客拉出斩首，韦小宝大声呼救，小玄子听到韦小宝的声音推开侍卫，拼命呼喊：小桂子。韦小宝这才发现和自己一起摔跤的小玄子就是当今皇帝康熙……
小桂子跪地连叫小玄子：皇上……让小康熙伤心之极大哭起来，小桂子再也不会和小玄子了真打真摔了。
海老公告诉韦小宝他早已经知道和他摔跤的就是当今皇上，海老公要韦小宝继续学功夫，要不小玄子会对他没有兴趣。
书房内，小康熙与鳌拜在处理苏克萨哈的事情上有严重分歧，引起鳌拜的愤恼，幸得偷听的小宝冲出来，机智把鳖拜的气焰消除，才让康熙免了这一劫。
小康熙带韦小宝来到他安排的布库房看摔跤，小康熙是别有用心的。
第四集
小康熙看见鳌拜对自己戒心消除，认为是消灭鳌拜好时机，小康熙巧设计谋，不露声色地召集布库房的小太监们来到书房，让鳌拜以为他安于逸乐，不闻朝政，于是寄情摔跤，让这群小太监以戏耍角力为名擒杀鳌拜，韦小宝陪伴在侧，见机行事突袭鳌拜。在皇上受到鳌拜的威胁时，韦小宝一招撒香灰让武艺高强的鳌拜摸不着头脑，被众太监用金丝钩擒住。
小康熙召来康亲王和索额图，并讹称鳌拜带刀行刺皇上为由，将鳌拜欺君犯上的罪名监禁，并下令抄家，派索额图和韦小宝到鳌家寻找四十二章经。
索额图深知皇上用意，在鳌家这一老一小结拜为兄弟，假戏真做，收买心腹眼线。也将自己官场发财秘诀相授于年幼的韦小宝，韦小宝也意外地得到了锋利的宝刀及护甲衣两件宝物。
小康熙和小韦小宝将鳌家抄来的两本《四十二章经》送给皇太后，皇太后得知小宝擒拿鳌拜有功，升他为六品首领太监，但这时的小韦小宝正等待机会离开皇宫。
第五集
韦小宝得到太后赏赐，由宫女蕊初陪同小韦小宝吃蜜饯，小韦小宝乐在其中，对蕊初姐姐别有一番情义，约蕊初夜晚在后花院中一起吃蜜饯。
海大富准备动手杀了韦小宝之后，再去找皇太后讨说法。韦小宝见海公公入睡，悄悄起床要找宫蕊初约会，却被海公公拦下，逼问韦小宝说出是谁指使他潜伏在他身边的，是谁指使他毒瞎他的眼睛。海公公早就对韦小宝有疑心，每天在他喝的汤里下了毒，让他一天天的痛死过去，韦小宝抽出宝刀和海公公拼个死活，被海公公一掌打飞出门，海公公中刀发现小宝不见，没想到韦小宝有宝衣护身保住了性命，又来到慈宁宫找蕊初赴约。
海公公到慈宁宫告之太后有关顺治帝在五台山的消息，且查明瑞敬皇后及荣亲王是被太后所杀，于是双方大打出手，两败俱伤，小宝在一旁观战，得知了有关皇室的秘密，小宝乘机把海公公杀死，救下太后。皇太后为封韦小宝的嘴，封他做了尚膳司副总管，没上任太监就送来了第一笔银票。韦小宝决定在宫中多呆上几年。
韦小宝陪伴着康熙度过快乐的每一天……二人长大成年……
韦小宝和康熙来到儿时比武的练武厅中，韦小宝这些年来都不敢与康熙真得摔跤，他那求饶的奴才样激怒了康熙，康熙痛骂韦小宝，韦小宝任由康熙摔打都不还手，康熙伤心地自己打起了皮人，韦小宝看着伤心的康熙，想起了儿时的他们，为了让小玄子开心，决定再做回小桂子……二人又回到了童年，开心地摔打着……
第六集
鳌拜在牢中经常胡言乱语，康熙恐怕鳌之馀党反抗，暗示小宝将鳌拜消灭，当小宝正在暗杀鳌拜之际，巧遇天地会也前来刺杀鳌拜。韦小宝在误打误撞之下，将鳌拜杀死，却被天地会众人捉走。韦小宝看到天地会的英雄好汉将鳌拜首级祭祀亡灵时，搞不清楚是怎么回事，和天地会众好汉说起了他被掳进宫的事情，说起了茅十八……韦小宝怎么也没想到在天地会青木堂内能又遇到茅十八，才得以保住性命。
康熙知道韦小宝被捉，非常震怒，逼康亲王及索额图尽快寻回。
天地会誓言，谁杀了鳌拜谁就来做香主，这一时为争青木堂香主之位天地会的英雄好汉们没了主意，准备带着这个杀了鳌拜的清廷太监去见总舵主陈近南。
韦小宝见到陈近南有一种特殊的感觉，很乖乖地把实情都说了出来，陈近南得知韦小宝是个冒牌太监，正和他意，以免天地会兄弟之争伤了和气，陈近南召集天地会兄弟在尹香主的灵位前宣布收韦小宝为徒，并封他为青木堂香主。
韦小宝按照陈近南的安排回到皇宫，骗取了皇上。躲过了这一劫。
小宝藉词出宫打听鳌拜余党，乘机来见陈近南。韦小宝毒发，陈近南为他施内功逼毒出来，小宝感激不尽。奉陈近南之命继续回到皇宫卧底。
杀了鳌拜之后，康熙长大了，敢于想，敢于做，韦小宝的一切行动就尽在康熙的掌握中了，二人慢慢有了转变，形成了“控制”的关系，“君臣”关系真正确定了。
第七集
皇上提到天地会让韦小宝心惊胆颤，捏着一把冷汗。
天地会徐天川神秘失踪，韦小宝被秘密召来拿主意，原来徐天川与沐王府双白因为谁是光复大业的正统而引起争执，导致徐天川伤重垂危，白寒松丧命。天地会认为沐王府为了寻仇而将徐天川捉走。
于是天地会钱老本将沐王府小郡主沐剑屏掳来送进宫中交给韦小宝看管，以免辱没了小郡主的身份。
小郡主“委婉的默许，特有的单纯”吸引了韦小宝，韦小宝和她玩起了少男少女的游戏。把小郡主摸成了一个大花猫的样子寻开心。
云南平西王吴三桂之子吴应熊作客于康亲王府，其手下皆武功非凡，王府中人挑衅亦忍让，小宝佩服并暗中笼络。听戏时，小宝无意中发现邓炳春鬼鬼祟祟地来到康亲王的佛堂，韦小宝好奇之心跟着邓炳春来到佛堂，原来他们在转移一本《四十二章经》，却被韦小宝轻而易举地盗去了这本经书。
第八集
沐王府带着“大明山海关总兵府字样”的兵器进宫行刺，来诬陷云南平西王吴三桂。
皇太后决杀韦小宝以免有后患，但反被小宝所伤。沐王府等人被侍卫围攻，追杀到了韦小宝的住处，方怡因抵不过让众兄弟暂时躲避，在韦小宝房中的沐剑屏闻听刺客用其沐王府的暗号，并求韦小宝出手相救，带方怡师姐回房内疗伤。韦小宝为方怡疗伤仍不忘调戏一番，可在紧急关头，韦小宝还出手援助，让沐剑屏对他另眼相看。
皇太后杀韦小宝未能得手，又派收卖的宫中侍卫瑞栋来杀小宝，韦小宝洞悉是太后所为，吓唬瑞栋，引他入室，武功高强的瑞栋反被韦小宝所杀，并取走他身上的四十二章经。太后接连又派太监冒充皇上的太监骗得韦小宝去其寝宫，欲杀韦小宝。
第九集
路上，这帮太监的动机却被韦小宝机灵悉破，利用银票逃脱，太后无奈又亲自下手拦截韦小宝，韦小宝利用瑞栋花言巧语讹称已得悉太后秘密逼太后放手。韦小宝中了太后一掌化骨绵掌，回房赶紧把瑞栋的消尸灭迹，以免不测。
沐王府众人被抓，方怡担心师哥刘一舟，小宝地帮她打听。康熙问起小宝杀刺客的经过，小宝顺势称赞康熙教导武功有方，康熙推测刺客的招数非平西王府中人。康熙教小宝拿着刺客证物去敲诈吴应熊，趁机探其虚实，回宫后小宝将所见告诉康熙，康熙从中猜测吴三桂已秘密上京且有意谋反。韦小宝用吴应熊所赠之银两收买人心。
沐剑声从吴应熊手上救出徐天川，却要天地会为徐天川误杀白寒松一事作出交代，小宝以香主身分答应救出沐王府刺客以抵徐天川之过。
第十集
韦小宝回宫后将反贼情况汇报给康熙，康熙心中早已有数，命韦小宝将刺客放走，以引出主谋。韦小宝牢中戏弄刘一舟，房中挑逗方怡，让方怡对他痛恨入骨，紧急时韦小宝却装出大丈夫的气魄帮助方怡，让方怡为之感动，写信给牢中的刘一舟师哥，让他们配合韦小宝救他们出去。刘一舟、吴立身见到韦小宝拿来方怡的字据和花押标记也都相信了韦小宝，配合韦小宝，假装要喝酒，韦小宝却不给喝，却让众侍卫喝，碰巧，皇太后派老太监董金魁来牢房找韦小宝，却被韦小宝也诬陷灌酒刺死，韦小宝便顺水推舟救出刘一舟、吴立身、敖彪三人。同时也取得方怡姑娘发誓嫁他为妻的誓言，一举两得。
在康熙的安排下，张康年配合韦小宝救人的行动天衣无缝。
